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Nature子刊:患者來源的類器官,為乳腺癌腦轉(zhuǎn)移帶來新見解

來源:上海西遞實(shí)業(yè)有限公司 發(fā)布時(shí)間:2023-12-26

近日,Nature Communications 期刊發(fā)表了一篇題為:Genomic profiling and pre-clinical modelling of breast cancer leptomeningeal metastasis reveals acquisition of a lobular-like phenotype 的研究論文。該研究利用腦脊液(CSF)的細(xì)胞游離DNA(cfDNA)和CSF播散性腫瘤細(xì)胞(DTC)來探索乳腺癌軟腦膜轉(zhuǎn)移(BCLM)的克隆演變以及軟腦膜和顱外轉(zhuǎn)移部位之間的異質(zhì)性。首次揭示了乳腺癌軟腦膜轉(zhuǎn)移(BCLM)細(xì)胞早期從乳腺原發(fā)腫瘤擴(kuò)散,并獲得了通常與小葉性乳腺癌相關(guān)的特征。>>>商務(wù)洽談,點(diǎn)此處,在線咨詢

該研究還使用腦脊液中播散性腫瘤細(xì)胞(DTC)構(gòu)建了乳腺癌軟腦膜轉(zhuǎn)移(BCLM)患者來源的腫瘤類器官,并進(jìn)一步構(gòu)建了BCLM的體內(nèi)動(dòng)物模型。這些微型腫瘤類器官模擬了細(xì)胞與周圍環(huán)境相互作用的生理環(huán)境,幫助研究人員更詳細(xì)地了解乳腺癌軟腦膜轉(zhuǎn)移(BCLM)。

Nature子刊:患者來源的類器官,為乳腺癌腦轉(zhuǎn)移帶來新見解

在這項(xiàng)研究中,研究團(tuán)隊(duì)嘗試了一種新的、更少侵入性的獲取腫瘤組織進(jìn)行分析的方法——液體活檢。腫瘤細(xì)胞會(huì)釋放循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)到體液(例如血液)中,形成細(xì)胞游離DNA(cfDNA),這些cfDNA是由身體中各種細(xì)胞釋放的DNA片段的集合。收集這些體液的樣本可以揭示關(guān)于癌癥及其與環(huán)境的相互作用的信息。

之前的研究使用下一代測序(NGS)技術(shù),來檢測腦脊液(CSF)中有限數(shù)量基因的變異。而這是第一項(xiàng)進(jìn)行大規(guī)模全外顯子組下一代測序的研究,涵蓋了同一患者的血漿和腦脊液(CSF)中的所有20000個(gè)基因。此外,還對來自原發(fā)乳腺癌腫瘤和癌癥擴(kuò)散到其他部位的組織進(jìn)行了測序。這種方法使得軟腦膜轉(zhuǎn)移細(xì)胞的遺傳物質(zhì)與身體其他部位的遺傳物質(zhì)進(jìn)行比較成為可能。

Nature子刊:患者來源的類器官,為乳腺癌腦轉(zhuǎn)移帶來新見解

全外顯子組測序技術(shù)對BCLM的分子特征進(jìn)行分析

研究團(tuán)隊(duì)還使用播散性腫瘤細(xì)胞(DTC)——從原發(fā)腫瘤分離并擴(kuò)散到軟腦膜的惡性細(xì)胞,構(gòu)建了乳腺癌軟腦膜轉(zhuǎn)移(BCLM)患者來源的腫瘤類器官,并進(jìn)一步構(gòu)建了BCLM的體內(nèi)動(dòng)物模型。這些微型腫瘤類器官模擬了細(xì)胞與周圍環(huán)境相互作用的生理環(huán)境,幫助研究人員更詳細(xì)地了解乳腺癌軟腦膜轉(zhuǎn)移(BCLM)。通過對樣本之間的比較,該研究發(fā)現(xiàn),軟腦膜轉(zhuǎn)移腫瘤細(xì)胞獲得了額外的突變,包括一些可能影響治療反應(yīng)的突變。因此,BCLM的遺傳物質(zhì)與原發(fā)性乳腺腫瘤的遺傳物質(zhì)明顯不同。在腦脊液cfDNA和原發(fā)性腫瘤中出現(xiàn)的突變總數(shù)中,48%僅出現(xiàn)在腦脊液cfDNA中,而20%僅出現(xiàn)在原發(fā)性腫瘤中。同樣,在腦脊液cfDNA和血漿cfDNA中的所有突變中,25%僅出現(xiàn)在前者,而17%僅出現(xiàn)在后者。

通過使用ClonEvol可視化分析工具來觀察BCLM的演變,研究團(tuán)隊(duì)還證實(shí)了BCLM在早期階段就開始與原發(fā)性腫瘤在遺傳上不同。這些發(fā)現(xiàn)表明,BCLM以增強(qiáng)其在軟腦膜部位存活的方式進(jìn)化。根據(jù)對播散性腫瘤細(xì)胞(DTC)及腫瘤類器官的觀察,研究團(tuán)隊(duì),這種生物適應(yīng)也使細(xì)胞在內(nèi)分泌器官(包括卵巢)中具有生長優(yōu)勢。他們認(rèn)為,這表明細(xì)胞變得類似于小葉性乳腺癌細(xì)胞,它們使用內(nèi)分泌器官中的激素來生長。比較軟腦膜轉(zhuǎn)移與身體其他部位轉(zhuǎn)移的進(jìn)化差異,血漿cfDNA比腦脊液cfDNA更容易受到化療的影響。這表明血腦屏障和血腦脊液屏障在一定程度上保護(hù)了軟腦膜中的癌細(xì)胞。

Nature子刊:患者來源的類器官,為乳腺癌腦轉(zhuǎn)移帶來新見解

總的來說,該研究利用腦脊液(CSF)的細(xì)胞游離DNA(cfDNA)和CSF播散性腫瘤細(xì)胞(DTC)來探索乳腺癌軟腦膜轉(zhuǎn)移(BCLM)的克隆演變以及軟腦膜和顱外轉(zhuǎn)移部位之間的異質(zhì)性。81% (17/21)的BCLM病例檢測到具有潛在治療作用的體細(xì)胞突變,其中19%僅在腦脊液cfDNA中檢測到。該研究首次揭示了乳腺癌軟腦膜轉(zhuǎn)移(BCLM)細(xì)胞早期從乳腺原發(fā)腫瘤擴(kuò)散,并獲得了通常與小葉性乳腺癌相關(guān)的特征。

該研究還通過對腦脊液播散性腫瘤細(xì)胞(DTC)的3D培養(yǎng),建立了BCLM患者來源的腫瘤類器官,并用于成功生成BCLM體內(nèi)動(dòng)物模型。這些數(shù)據(jù)進(jìn)一步揭示了BCLM具有獨(dú)特的基因組突變譜,為這種難治性轉(zhuǎn)移性疾病提供了潛在治療靶點(diǎn)。

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注射患者來源的類器官,構(gòu)建BCLM小鼠模型

總的來說,該研究證明了對腦脊液進(jìn)行液體活檢,以及隨后構(gòu)建的患者來源的類器官的潛力,該研究描述的檢測方法和構(gòu)建的BCLM小鼠模型為乳腺癌軟腦膜轉(zhuǎn)移(BCLM)研究提供了及時(shí)的資源,有望幫助改善患者的治療選擇和生存。

來源:生物世界

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【項(xiàng)目成果】:該工程是CEIDI西遞全程運(yùn)用EPC(工程總承包)模式服務(wù)建設(shè)的項(xiàng)目之一。作為一家專業(yè)提供生物醫(yī)藥非臨床研究服務(wù)為主的綜合研發(fā)服務(wù)(CRO)企業(yè),2023年,益諾思上海多元化實(shí)驗(yàn)檢測平臺(tái)在原有實(shí)驗(yàn)中心基礎(chǔ)上升級改造,CEIDI西遞設(shè)計(jì)團(tuán)隊(duì)為其進(jìn)行實(shí)驗(yàn)檢測平臺(tái)的整合規(guī)劃及環(huán)境設(shè)計(jì),結(jié)合其PCR等技術(shù)的核酸、基因與細(xì)胞治療產(chǎn)品分析技術(shù)所需實(shí)驗(yàn)凈化環(huán)境、功能用室布局、氣體管網(wǎng)架設(shè)、儀器/凈化設(shè)備和實(shí)驗(yàn)家具布局等元素,為用戶打造滿足既定實(shí)驗(yàn)功能平臺(tái)的一站式解決方案。

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